Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fyco1Q8VDC1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fyco1Q8VDC1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms