Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssx2ipQ8VC66 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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