Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slf1Q8R3P9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms