Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf183Q8QZS5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms