Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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