Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ssh3Q8K330 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms