Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf39Q8K2Z2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms