Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim68Q8K243 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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