Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Nek9Q8K1R7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nek9Q8K1R7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms