Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sde2Q8K1J5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms