Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Hmgcll1Q8JZS7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hmgcll1Q8JZS7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms