Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Afg3l2Q8JZQ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms