Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim61Q8JZK6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim61Q8JZK6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim61Q8JZK6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms