Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf628Q8CJ78 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms