Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip10Q8CJ53 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip10Q8CJ53 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms