Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LgsnQ8CIX8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms