Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TwnkQ8CIW5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwnkQ8CIW5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms