Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arhgap29Q8CGF1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms