Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Setd1bQ8CFT2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Setd1bQ8CFT2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms