Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ercc8Q8CFD5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ercc8Q8CFD5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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