Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms