Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc73Q8CDM4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc73Q8CDM4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc73Q8CDM4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms