Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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