Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Samd4aQ8CBY1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Samd4aQ8CBY1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Samd4aQ8CBY1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Samd4aQ8CBY1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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