Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Atg4aQ8C9S8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Atg4aQ8C9S8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Atg4aQ8C9S8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4aQ8C9S8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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