Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc90bQ8C3X2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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