Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdac7Q8C2B3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms