Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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