Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim35Q8C006 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim35Q8C006 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim35Q8C006 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim35Q8C006 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim35Q8C006 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim35Q8C006 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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