Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc2Q8BZW8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms