Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo38Q8BMI0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms