Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp54Q8BL06 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms