Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pum3Q8BKS9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pum3Q8BKS9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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