Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms