Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd6Q8BGE4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms