Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Htatsf1Q8BGC0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Htatsf1Q8BGC0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms