Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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