Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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H2-M10.2Q85ZW9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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H2-M10.2Q85ZW9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.2Q85ZW9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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