Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NfascQ810U3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms