Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc172Q810N9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms