Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrfn4Q80XU8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lrfn4Q80XU8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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