Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ttc28Q80XJ3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ttc28Q80XJ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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