Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chn2Q80XD1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chn2Q80XD1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms