Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpp38Q80UU2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms