Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf8Q80TJ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms