Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms