Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ClmQ7TSN2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClmQ7TSN2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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