Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dsg1cQ7TSF0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms