Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek5Q7TSC3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek5Q7TSC3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms