Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LnpkQ7TQ95 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms